战船之上举行了一次大朝会。以南京之战论功行赏，洪承畴因为获得了首功，被升为御营五军都指挥同知——从二品，之后有高必正被封武安候仍然挂龙虎将军印、蒋建勋升为总兵官——但是这一职位在目前的明军中只是一个临时职位，和巡抚的用意差不多、秦拱明正式的升为了御营石柱军指挥使。陈友龙的御营97000人合并入御营伍军，陈友龙任御营伍军都指挥佥事。又有一系列的军事调度在这次朝会中宣布。郝永忠的御营左前军移防扬州；高必正出军河南南阳接替李定国在那里的驻防；李定国则绕道武关去换防李锦的潼关，因为这样换防可以避开清军的袭扰；李锦移防陕北；王允才、王进才结束修整后分别驻防汉口和九江，并将清军降卒分别补充给他二人，之后王允才部增加到了10800人，王进才增加到了11000人。但是所有能够参加这次朝会的文臣武将的调令都要等待在一件大事完毕之后才可以被执行，这件事便是祭奠孝陵。ii

凄惶的颠沛了数年，终于找到了一个城市能让朱四有一种归属的感觉，南京的意义对他这个大明天子以至于普通的庶人都不仅仅是一座城市那么简单，她是这个战火频仍的年代里汉家子们心灵的支点、是一记可以疗伤的汤药。大明重新夺回了南京城，终于让大明人享受到了国家的成就带给个人的荣耀与支撑。也让很多人从中认识到了国家的荣耀所带给个人与家庭的满足感不同于其他却高于其他。国对于家的支撑就是可以使每一个家能够在这个国中立命安身。不再被无缘无故的杀戮、也不再有无处争辩的抢夺。虽然这个国家里的人民比较特殊，虽然这里的百姓重视家的观念总要多于对国的热爱。但是此时此刻，无论是准备祭拜孝陵的朱四，还是许许多多高兴着、欢庆着、热泪盈淌的普通人，在他们的内心中，家与国的联系此生都从未有过像如今这样的密不可分。ii

在敌对势力间的每一场大战过后，胜利者的第一件事情除了论功行赏外，多数还会清理占领地的敌顽残余势力，以及曾经帮助过敌人的汉奸走狗。南京城如今也是这样。那些家门口曾经被画了各种各样的圈圈的民宅里，真的有一些人被大明的锦衣卫和五城兵马司抓了出来。他们被游街、示众，被各种凌虐和展览之后当街斩首。